Το κτήριο της Ιονίου Ακαδημίας, όπως είναι ευρύτατα γνωστό, οικοδομήθηκε την περίοδο της Ενετοκρατίας και αρχικά λειτουργούσε ως στρατώνας. Το 1841 μεταφέρθηκε και λειτούργησε εκεί η Ιόνιος Ακαδημία, το πρώτο ελληνικό Πανεπιστήμιο, που είχε ιδρυθεί το 1824.  Η Ιόνιος Ακαδημία αποτέλεσε το ανώτατο εκπαιδευτικό Ίδρυμα του Ιονίου Κράτους, με έδρα την  Κέρκυρα και οφείλεται κυριότατα στον Άγγλο φιλέλληνα Φρέντερικ Νορθ, κόμη του Γκίλφορντ. Αρχικά λειτουργούσαν τέσσερις σχολές: Νομική, Θεολογική, Ιατρική, Φιλοσοφική ενώ αργότερα προστέθηκαν η Πολυτεχνική, Μαιευτική και Φαρμακευτική. Ήταν τέτοιο το κύρος της που οι σπουδαστές της έρχονταν από πολλά μέρη της Ελλάδας για να φοιτήσουν στην Κέρκυρα. Έτσι, συνέβαλε ουσιαστικά στην πνευματική αναγέννηση του νέου ελληνισμού του 19^ου αι. Μετά την Ένωση της Επτανήσου με την Ελλάδα, το 1864, η τότε ελληνική κυβέρνηση κατάργησε την Ιόνιο Ακαδημία. Έκτοτε, στο κεντρικό τμήμα του κτιρίου στεγάστηκε η Ιστορική Δημόσια Βιβλιοθήκη Κέρκυρας μέχρι το 1943, όταν κάηκε από τους γερμανικούς βομβαρδισμούς. Το 1994 αναστηλώθηκε και σήμερα στεγάζει την Πρυτανεία του Ιονίου Πανεπιστημίου.